制药工程考研的专业选择主要集中在以下几个方向：

药学专业：

这是最直接的考研方向，涉及药品生产、检验、流通、使用和研究与开发等领域的工作。药学专业的学生需要具备药学学科的基本理论和基本知识。

化学工程与技术专业：

这个专业涵盖了化学工程与技术、分析化学、高分子化学与物理、材料物理化学等领域，为制药工程提供了丰富的知识基础和实践经验。

中药学专业：

培养具备中药学基础理论、基本知识、基本技能以及与中医学、药学等相关知识和能力的高级科学技术人才，涉及中药生产、检验、流通、使用和研究与开发等领域。

药物化学专业：

这是制药工程本科生最多的考研方向之一，尤其是男生，涉及药物的设计、合成、分析等方面。

药剂学专业：

培养具备药剂学基本理论、基本知识和实验技能的高级科学技术人才，涉及药物制剂的制备、质量控制、使用等方面。

药物分析专业：

培养具备药物分析基本理论、基本知识和实验技能的高级科学技术人才，涉及药物的质量控制、分析方法的研究与应用等方面。

药理学专业：

研究药物与生物体相互作用的规律，涉及药物的作用机制、药效学、药代动力学等方面。

生物制药专业：

结合生物学和化学知识，研究和开发生物制品，如疫苗、抗体、生物药物等。

建议

兴趣导向：首先，考虑自己的兴趣和职业规划。如果对药物的设计、合成和分析感兴趣，可以选择药物化学或药剂学方向。如果对中药的生产和研究感兴趣，可以选择中药学专业。如果对化学工程和技术在制药中的应用感兴趣，可以选择化学工程与技术专业。

就业前景：社会对药学人才的需求正在增加，药学专业的就业率高达95%。此外，生化药品是一个新兴且尖端的行业，发展前景很好。

目标院校：根据自己的本科背景和目标院校的排名和专业设置，选择适合自己的考研专业。例如，如果本科课程中各类化学学得扎实，药学方面的专业比较好考。

考试科目：了解不同专业的考试科目，选择适合自己的科目组合。例如，药学专业的研究生考试通常不考高数，以化学为主。

综合考虑以上因素，制药工程考研的专业选择应根据个人兴趣、职业规划以及目标院校的具体要求来确定。