三方就业合同的签订流程一般包括以下几个步骤：

与用人单位达成就业意向

毕业生需要先与用人单位达成就业意向，确定就业单位和岗位。

申请就业协议书

毕业生向学校就业指导中心申请就业协议书。一般情况下，学校会提供格式化的三方协议书，毕业生需按照要求填写相关信息。

毕业生填写相关信息

毕业生依据实际情况如实填写“毕业生基本情况”，填写时要注意自己的专业名称是否与毕业证书、学位证书上的专业名称一致。

用人单位盖章

填写好的三方协议后，提交给用人单位，由用人单位签署意见并盖章。

学校盖章

用人单位填写完毕并盖章后，需要由院系或学校就业部门审核并盖章。

档案托管

须携带毕业材料去公共就业人才服务机构或单位办理相关手续，完成档案转移手续。

需要注意的是，三方协议书只是毕业生、用人单位、学校三方之间签订的就业意向，不是劳动关系的法律文件，对劳动关系没有约束力。建立劳动关系，应当订立书面劳动合同。

在签订三方就业合同时，建议毕业生认真如实填写基本情况及应聘意见，并签名；用人单位、主管部门及人事调配部门应签订意见；用人单位一定要将档案详细快递地址填好；各院系应签意见；学校就业指导中心应签意见。按程序用人单位先签章，再由学校签章，作最后把关，这样更有利于维护毕业生合法利益。

此外，三方协议的“备注”部分允许三方另行约定各自的权利义务。为防止用人单位的承诺无法落实，毕业生可以将工资、奖金、补贴、休假、住房、保险等协商好的福利待遇在备注栏中写清楚，不要留白。

最后，正式签订三方协议时，一定要仔细和慎重，看清三方协议的每一则条款，注意用人单位名称，观察用人单位名称是否与印章名称一致，确保无误后再签订。