灵活就业人员的军龄计算方式如下：

实际服役时间计算

如果灵活就业人员是通过报名参军、服役一段时间后转为灵活就业的，或者是在灵活就业期间被征召入伍服役的，那么其退休后的军龄应当按照实际服役时间计算。

档案认定

灵活就业人员当过兵的，只要档案完整，在退休时提交，劳动行政部门在审批退休时会根据档案来认定为视同缴费年限。视同缴费年限和以后的缴纳社保的年限合并为养老保险的缴费年限，这样可以使缴费年限更长，待遇也会更高。

累计计算

自谋职业的灵活就业人员，军龄可以视同缴费年限累计计算，缴满15年即可。农村籍退役军人进城务工的，务工年限可以和军龄累计计算为工龄，不够15年的，可以以灵活就业身份继续参加社保缴纳至满15年。

军龄补贴

以灵活就业方式自行购买社保的老兵，服役年限会计算在社保缴纳的年限中，无法领取额外的军龄补贴。军龄补贴政策的初衷是保障无工作老兵的基本生活。

建议

保留相关档案：灵活就业人员应妥善保管参军入伍的相关档案，以便在退休时能够提供完整的服役记录。

咨询当地政策：由于不同地区和单位的情况有所不同，建议灵活就业人员咨询当地劳动行政部门或社保机构，了解具体的政策和计算方法。

及时缴纳社保：为了确保退休后的待遇，建议灵活就业人员及时缴纳社保，并保持军龄和社保缴纳年限的累计。