如果发现就业协议是虚假的，可以采取以下步骤处理：

收集证据

收集与虚假就业协议相关的所有证据，例如工资发放记录、工作考勤记录、与同事的交流记录等，这些证据能够证明就业协议的虚假性。

与用人单位协商

向用人单位表明知晓合同虚假的情况，并要求其纠正错误，重新签订真实的就业协议。如果用人单位愿意配合，可以避免进一步的法律纠纷。

投诉举报

如果用人单位拒绝改正，可以向当地的人力资源和社会保障部门（劳动监察部门）投诉举报。劳动监察部门会对用人单位进行调查核实，并责令其改正违法行为。

申请仲裁或诉讼

如果劳动监察部门无法有效解决问题，可以向劳动争议仲裁委员会申请仲裁，要求确认就业协议无效，并要求用人单位承担相应的法律责任，如支付经济补偿等。

在仲裁或诉讼过程中，需要提供充分的证据证明就业协议的虚假性，以及因此造成的损失。

注意法律后果

伪造三方协议一旦查实，如果签约单位较真，毕业生可能面临档案里记录不诚信的痕迹，学校面临被索赔，甚至取消毕业生的应届毕业生就业资格。

签署三方协议后，若遇造假行为，需按协议中违约条款承担相应责任。

法律咨询

在处理虚假就业协议的过程中，建议咨询专业的法律人士，以获得更具体的法律建议和支持。

通过以上步骤，可以有效地处理虚假就业协议的问题，维护自己的合法权益。