在工科考研中，以下专业普遍被认为难度较高：

计算机科学与技术：

该专业需要掌握计算机科学、数学和工程学方面的知识，学习难度大，且竞争激烈。

电气工程及其自动化：

电气工程被认为是工科中难度最高的专业之一，对工程实践和创新有较高的要求。

机械工程专业：

该专业对动手能力和理论知识的掌握都有较高要求，学习难度较大，但就业率较好。

信息与通信工程：

该专业不仅包括通信工程的基础知识，还涉及多媒体、无线通信等高技术领域，对数学、物理和计算机基础知识有较高要求。

建筑学类专业：

建筑学专业培养未来从事建筑规划和设计的高级技术人才，需要具备强大的分析和解决问题的能力，学习强度大，且绘图和理论要求高。

自动化专业：

自动化专业涉及工业过程控制和嵌入式系统方向，学习难度较高，因为需要掌握广泛的领域知识，并且具备创新思维和解决问题的能力。

生物医学工程：

该专业结合了医学和工程学的知识，需要深入了解生物学和医学知识，以及工程方面的技术，技术和创新能力要求极高。

核工程：

核工程涉及核物理学、核化学等领域，学习难度较大。

化学工程：

化学工程专业的考研难度也较大，需要学生具备扎实的理论知识和实践能力。

材料科学与工程：

该专业涉及材料的设计、制备、加工和应用，学习难度较高。

动力工程及工程热物理：

虽然专业知识要求高，但竞争可能不如一些更热门的工科专业激烈。

软件工程：

随着计算机应用的普及，软件工程专业的学习难度也较高，需要掌握编程基础和不断实践。

水利工程：

尽管入门难度较大，但就业前景较好，尤其是水利工程，由于市场上人才较少，各行各业都需要水利人才，因此该专业的就业前景非常好。

土木工程：

该专业要求学生理解水资源管理和大型水利项目的建设，专业知识面较广，但报考人数相对较少，可能存在一定的录取优势。

总体来说，计算机科学与技术、电气工程及其自动化、机械工程专业、信息与通信工程、建筑学类专业、自动化专业、生物医学工程、核工程、化学工程、材料科学与工程、动力工程及工程热物理、软件工程、水利工程和土木工程是工科考研中难度较高的专业。考生应根据自身兴趣和职业规划，选择合适的专业进行报考。