茅以升学院的专业设置涵盖了多个学科领域，旨在培养具有创新能力、科学研究能力、国际竞争力的领袖人才。具体专业如下：

土木类：

包括土木工程、水利水电工程、港口航道与海岸工程、船舶与海洋工程等专业方向。

机械类：

包括机械工程、机械设计制造及其自动化等专业。

电气类：

包括电气工程及其自动化、电工电子等专业。

交通运输类：

包括交通运输工程、车辆工程、地质工程、测绘工程等专业。

电子信息类：

包括电子信息工程、通信工程等专业。

材料类：

包括材料科学与工程等专业。

力学类：

包括力学等专业。

金融类：

包括金融学等专业。

测绘类：

包括测绘工程等专业。

中文类：

包括汉语言文学等专业。

数学类：

包括数学与应用数学等专业。

此外，茅以升学院还提供一些具体的专业方向，例如建筑工程（茅以升班）可选择土木工程、水利水电工程、港口航道与海岸工程、船舶与海洋工程等专业方向。

这些专业覆盖了茅以升学院的主要学科领域，旨在培养具有创新能力、科学研究能力、国际竞争力的领袖人才。