黄药师的结局在金庸先生的武侠小说《射雕英雄传》中并没有明确的描述，因此存在多种推测和解读。以下是一些主要的说法：

悲伤过度而死

黄药师在得知郭靖和黄蓉的死因后，悲伤过度，最终死在了古墓中。

襄阳大战中遭遇不幸

有推测认为，黄药师可能在襄阳大战中遭遇不幸，死于忽必烈的铁骑之下。这一推测虽有其合理性，但并未得到金庸的明确证实。

隐退后死于桃花岛

另一种说法是，黄药师在襄阳大战后选择了隐退，最终死于桃花岛。但为何他的尸骨未见，这一点令人费解。

与冯蘅共同葬身大海

黄药师最有可能的死法是回到桃花岛，利用他精心打造的花船，和爱妻冯蘅共同葬身在大海中。黄蓉曾经提到黄药师造了一艘花船，准备与她相会，这艘船最终成为他们殉情的工具。

孤独地死在桃花岛

桃花岛的最后一夜，黄药师悄悄死在桃花岛的一间隐秘小屋里，连个像样的送别都没有。他的武功无人能敌，行事却怪异得让人摸不着头脑，最终竟以这种方式结束了他的一生。

综合以上说法，虽然金庸先生并未明确描述黄药师的结局，但结合小说情节和历史背景，可以推测黄药师可能是在经历了种种变故后，选择与妻子冯蘅一同殉情，或者是在桃花岛孤独地逝去。