潍坊商业学校设有多个系，开设了一系列中专、大专和高级技工专业。具体专业如下：

财会系

会计

会计电算化

经贸系

经济管理

工商企业管理

电子商务

物流管理（配送运输管理方向）

市场营销（连锁经营与超市管理）

旅游系

旅游服务与管理

酒店服务与管理

航空服务

理工系

工程机械

塔吊租赁与销售

塔吊标准节与配件批发

计算机网络技术

室内装饰设计

计算机平面设计（广告设计方向）

动漫制作

电信传媒

速录与文秘

制冷和空调设备运行与维修

汽车运用与维修

汽车商务

维修电工

智能楼宇维修

汽车电子维修

家电维修与经营

信息技术系

计算机软件

计算机网络技术

室内装饰设计

计算机平面设计（广告设计方向）

动漫制作

电信传媒

速录与文秘

海运系

船舶驾驶

轮机管理

国际合作系

商务日语（赴日研修与留学班）

商务英语（海外留学与就业班）

韩国语（韩国留学与就业班）

高级技工专业

电脑美术

制冷与冷藏技术

这些专业涵盖了财经、理工、艺术等多个领域，符合当前社会对人才的需求。学校注重实践教学，与多家知名企业合作，提供实验实训场所，提高学生的实际操作能力和就业竞争力。