有些专业会有多个专业代码的原因主要包括以下几点：

区分不同类型的专业

有些专业会分为学术型硕士和专业型硕士，例如工商管理专业，其学术型硕士代码为120200，专业型硕士代码为125100。

有些专业可能是中外合作办学，学费和教学方式与普通专业不同，因此会有不同的代码。

有些专业会针对特定地区或群体设立不同的招生代码，如贫困地区专项计划。

区分不同批次或计划性质的专业

同一批次中既有普通专业也有民族班专业等，这些专业可能有不同的招生计划和目标群体。

区分不同地理位置或校区

一些大学在不同地理位置设立不同的校区或分支机构，每个校区或分支机构可能拥有自己独立的标识代码。

历史原因和行政要求

有的大学可能因为历史原因或根据教育行政管理体系的要求，在不同的时间段使用了不同的代码。

学校内部分类

有些学校会将专业分为不同的层次或类型，如一本和二本，这可能导致不同的代码。

学校内部可能会有不同的管理系统或统计代码，用于不同的统计和管理目的。

学科门类或专业类型

有些专业可能属于不同的学科门类，这会导致不同的专业代码。例如，生物医学工程专业可能有两个代码，分别代表不同的学科门类。

招生计划和统计需要

学校在每年的招生计划中可能会设置不同的专业、批次和录取要求，因此会针对每个招生计划设置一个独立的代码。

有些代码可能用于学校的登记、招生等教育事务，而另一些代码可能用于财务、人力资源等管理事务。

国际代码和本地代码

有些高校会有国际代码和高考填志愿用的代码，这些代码可能因地区和高校的不同而有所变化。

综上所述，专业代码的存在主要是为了区分不同类型、层次、批次、地理位置或校区的专业，以及满足历史、行政、统计和管理等多方面的需求。